Dossier:Virus

Virus

Sommaire

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Virus
Un dossier de Qualitionnaire by AQTE sprl coordonné par Constant Depièreux

Virus

  • VIRUS TRANSMIS PAR LES ARTHROPODES (ARBOVIRUS) IDENTIFIES PAR LE CENTRE COLLABORATEUR OMS DE REFERENCE ET DE RECHERCHE SUR LES ARBOVIRUS (CRORA) DE L'INSTITUT PASTEUR DE DAKAR ET AUTRES VIRUS DU CONTINENT AFRICAIN

Virus - Classification de Baltimore

Virus à ADN

Groupe I - Virus à ADN à double brin

Ordre des Caudovirales (bactériophages à queue).

  • Famille des Myoviridae - exemple phage T4
  • Famille des Podoviridae
  • Famille des Siphoviridae - exemple phage λ

Non attribué

  • Famille des Ascoviridae
  • Famille des Adenoviridae - exemples kératites, angines ou diarrhées
  • Famille des Asfiviridae
  • Famille des Baculoviridae
  • Famille des Corticoviridae
  • Famille des Fuselloviridae
  • Famille des Guttaviridae
  • Famille des hépadnaviridae - exemples les virus humains de l'hépatite B ou VHB
  • Famille des Herpesviridae - exemples les virus humains de l'herpès ou le VZV (virus varicelle-zona)
  • Famille des Iridoviridae
  • Famille des Lipothrixviridae
  • Famille des Nimaviridae
  • Famille des Papovaviridae - exemples Papillomavirus ou Polyomavirus (virus simien 40)
Papillomavirus

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  • Famille des Phycodnaviridae
  • Famille des Plasmaviridae
  • Famille des Poxviridae - exemples virus de la vaccine, virus de la variole
  • Famille des Rudiviridae
  • Famille des Tectiviridae
  • Genres non classés
Mimivirus - exemple Acanthamoeba polyphaga mimivirus

Groupe II - Virus à ADN à simple brin

bactériophages non classés

  • Famille des Inoviridae
  • Famille des Microviridae

Virus non classés

  • Famille des Geminiviridae
  • Famille des Circoviridae
  • Famille des Nanoviridae
  • Famille des Parvoviridae - exemples virus de Norwalk ou Parvovirus B19 (qui dépend d'une co-infection à adénovirus pour la croissance)
  • Genres non classés
Anellovirus - exemple Torque teno virus

Virus à ARN

Groupe III - Virus à ARN à double brin

  • Famille des Birnaviridae
  • Famille des Chrysoviridae
  • Famille des Cystoviridae
  • Famille des Hypoviridae
  • Famille des Partitiviridae
  • Famille des Reoviridae - exemples Rotavirus ou Orthoreovirus
  • Famille des Totiviridae
  • Genres non classés
Endornavirus - exemple Vicia faba endornavirus

Groupe IV - Virus à ARN simple brin à polarité positive (Virus (+)ssARN ou de type ARN messager)

Ordre des Nidovirales (Virus "nidifiés")

  • Famille des Arteriviridae
  • Famille des Coronaviridae - exemple Coronavirus
  • Famille des Roniviridae

Non attribué

  • Famille des Astroviridae
  • Famille des Barnaviridae
  • Famille des Bromoviridae
  • Famille des Caliciviridae - exemple virus de Norwalk
Agent biologique/Biological agentPrincipales sources de contamination/Main contamination sourcesPrincipaux aliments potentiellement contaminés/Main food potentially contaminatedNormes de détection/Detection standards (P) ou de dénombrement/numbering standards (N)
norovirus Pollution fécale humaine Eau, végétaux, coquillages N.A.
Source: Adapté de Avis de l’Agence française de sécurité sanitaire des aliments relatif aux dangers microbiologiques des aliments consommés crus, AFSSA, saisine no 2008-SA-0172

Norovirus

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Alertes alimentaires liées à la présence de Norovirus reçues par le RAFSS ( à partir du 1/1/2011)

Date de l'alerte Coordonnées de l'alerte RASFF Alimentation humaine (H) ou animale (A) Pour en savoir plus sur ce site
4/02/2011 Notification detail - 2011.0145 - norovirus in frozen raspberries from China{{#set:Contaminant=Norovirus}}{{#set:Country_of_ origin=Chine}}{{#set:Non_Conform_Product=framboise}}{{#set:Alert=2011.0145}} H N.A.
4/02/2011 Notification detail - 2011.0136 - norovirus in frozen raspbarries from Serbia, via Sweden {{#set:Contaminant=Norovirus}}{{#set:Country_of_ origin=Serbie}}{{#set:Non_Conform_Product=framboise}}{{#set:Alert=2011.0136}} H N.A.
14/01/2011 Notification detail - 2011.0068 - norovirus (genogroup I) in frozen raspberries from Serbia, via Sweden {{#set:Contaminant=Norovirus}}{{#set:Country_of_ origin=Serbie}}{{#set:Non_Conform_Product=framboise}}{{#set:Alert=2011.0068}} H N.A.
Courtesy of Crises Alimentaires, a site of Applied Quality Technologies Europe sprl (BE0448550665).
Source : Dossier:Virus - Dernière révision : RiskManager - #88997 - 20180921073533
  • Famille des Closteroviridae
  • Famille des Comoviridae
  • Famille des Dicistroviridae
  • Famille des Flaviviridae - exemples virus de la fièvre jaune, virus du Nil occidental, virus de l'hépatite C, virus de la dengue

Dengue

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Fièvre jaune

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Fièvre du Nil occidental (West Nile)

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  • Famille des Flexiviridae
  • Famille des Hepeviridae - exemple virus de l'hépatite E
  • Famille des Leviviridae
  • Famille des Luteoviridae
  • Famille des Marnaviridae
  • Famille des Narnaviridae - virus à ARN nus
  • Famille des Nodaviridae
  • Famille des Picornaviridae - exemples virus de la Poliomyélite, Rhinovirus, virus de l'hépatite A, Coxsackie A virus et Coxsackie B virus
  • Famille des Potyviridae
  • Famille des Sequiviridae
  • Famille des Tetraviridae
  • Famille des Togaviridae - exemple Rubivirus (virus de la rubéole)

Chikungunya

(Address: 1 ieSim, London, United Kingdom, formerly at the Institute for the Environment, Brunel University West London, Uxbridge, UK and 2 School of Population Health, The University of Queensland, Brisbane, Australia)

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  • Famille des Tombusviridae
  • Famille des Tymoviridae
  • Genres non classés
  • Genre Benyvirus - exemple Beet necrotic yellow vein virus
  • Genre Cheravirus - exemple Cherry rasp leaf virus
  • Genre Furovirus - exemple Soil-borne wheat mosaic virus
  • Genre Hordeivirus - exemple Barley stripe mosaic virus
  • Genre Idaeovirus - exemple Raspberry bushy dwarf virus
  • Genre Machlomovirus - exemple Maize chlorotic mottle virus
  • Genre Ourmiavirus - exemple Ourmia melon virus
  • Genre Pecluvirus - exemple Peanut clump virus
  • Genre Pomovirus - exemple Potato mop-top virus
  • Genre Sadwavirus - exemple Satsuma dwarf virus
  • Genre Sobemovirus - exemple Southern bean mosaic virus, panachure jaune du riz
  • Genre Tobamovirus - exemple virus de la mosaïque du tabac
  • Genre Tobravirus - exemple Tobacco rattle virus
  • Genre Umbravirus - exemple Carrot mottle virus

Groupe V - Virus à ARN simple brin à polarité négative

Ordre Mononegavirales (virus à polarité négative non-segmentés)

  • Famille des Bornaviridae - Borna disease virus
  • Famille des Filoviridae - exemple virus Ebola, virus de la Fièvre hémorragique de Marbourg
  • Famille des Paramyxoviridae - exemples virus de la rougeole, virus des oreillons
  • Famille des Rhabdoviridae - exemples virus de la Rage

Virus à polarité négative segmentés

  • Famille des Arenaviridae - exemples virus de la fièvre de Lassa, virus Junin (fièvres d'Amérique du Sud)
  • Famille des Bunyaviridae - exemple Bunyavirus Phlebovirus Hantavirus
Genre Hantavirus (hantavirose, Fièvre hémorragique avec syndrome rénal (HFRS), néphropathie épidémique (NE), syndrome pulmonaire à hantavirus (HPS)
  • OMS
  • Belgique
  • Canada
  • Etats-Unis
  • France

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  • Famille des Orthomyxoviridae - virus de l'influenza A, B, et C (virus de la grippe)
  • Genres non classés
  • Genre Deltavirus - exemple virus de l'Hépatite delta
  • Genre Ophiovirus - exemple Citrus psorosis virus
  • Genre Tenuivirus - exemple Rice stripe virus
  • Genre Varicosaivirus - exemple Lettuce big-vein associated virus

Virus à ADN ou à ARN à transcription inverse

Groupe VI - rétrovirus à ARN simple brin

  • Famille Metaviridae
  • Famille Pseudoviridae
  • Famille Retroviridae - exemples VIH 1, HTLV (lymphome)

Groupe VII - Pararétrovirus à ADN double brin

  • Famille Hepadnaviridae - exemple virus de l'Hépatite B
  • Famille Caulimoviridae - exemple virus de la mosaïque du choux-fleur

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Virus - Taxinomie des virus: 2009 Release (International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV)).

Ordre: Caudovirales (3 Familles)

  • Famille: Myoviridae (8 Genres)
  • Famille: Podoviridae (2 Sous-Familles and 6 genres non inclus dans une Sous-Famille)
  • Famille: Siphoviridae (9 Genres)

Ordre: Herpesvirales (3 Familles)

  • Famille: Alloherpesviridae (4 Genres)
  • Famille: Herpesviridae (3 Sous-Familles)
  • Famille: Malacoherpesviridae (1 Genre)

Ordre: Mononegavirales (4 Familles)

  • Famille: Bornaviridae (1 Genre)
  • Famille: Filoviridae (2 Genres)
  • Famille: Paramyxoviridae (2 Sous-Familles)
Infection à virus Nipah

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  • Famille: Rhabdoviridae (6 Genres)

Ordre: Nidovirales (3 Familles)

  • Famille: Arteriviridae (1 Genre)
  • Famille: Coronaviridae (2 Sous-Familles)
  • Famille: Roniviridae (1 Genre)

Ordre: Picornavirales (5 Familles)

  • Famille: Dicistroviridae (1 Genre)
  • Famille: Iflaviridae (1 Genre)
  • Famille: Marnaviridae (1 Genre)
  • Famille: Picornaviridae (12 Genres)
  • Famille: Secoviridae (1 Sous-Famille and 5 genres non inclus dans une Sous-Famille)

Ordre: Tymovirales (4 Familles)

  • Famille: Alphaflexiviridae (6 Genres)
  • Famille: Betaflexiviridae (6 Genres)
  • Famille: Gammaflexiviridae (1 Genre)
  • Famille: Tymoviridae (3 Genres)

Familles de virus non assignée à un ordre (65 Familles)

  • Famille: Adenoviridae (5 Genres)
  • Famille: Ampullaviridae (1 Genre)
  • Famille: Anelloviridae (9 Genres)
  • Famille: Arenaviridae (1 Genre)
  • Famille: Ascoviridae (1 Genre)
  • Famille: Asfarviridae (1 Genre)
  • Famille: Astroviridae (2 Genres)
  • Famille: Avsunviroidae (3 Genres)
  • Famille: Baculoviridae (4 Genres)
  • Famille: Barnaviridae (1 Genre)
  • Famille: Bicaudaviridae (1 Genre)
  • Famille: Birnaviridae (4 Genres)
  • Famille: Bromoviridae (6 Genres)
  • Famille: Bunyaviridae (5 Genres)
  • Famille: Caliciviridae (5 Genres)
  • Famille: Caulimoviridae (6 Genres)
  • Famille: Chrysoviridae (1 Genre)
  • Famille: Circoviridae (2 Genres)
  • Famille: Closteroviridae (3 Genres)
  • Famille: Corticoviridae (1 Genre)
  • Famille: Cystoviridae (1 Genre)
  • Famille: Endornaviridae (1 Genre)
  • Famille: Flaviviridae (3 Genres)

Dengue

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Fièvre jaune

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Fièvre du Nil occidental (West Nile)

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  • Famille: Fuselloviridae (1 Genre)
  • Famille: Geminiviridae (4 Genres)
  • Famille: Globuloviridae (1 Genre)
  • Famille: Guttaviridae (1 Genre)
  • Famille: Hepadnaviridae (2 Genres)
  • Famille: Hepeviridae (1 Genre)
  • Famille: Hypoviridae (1 Genre)
  • Famille: Inoviridae (2 Genres)
  • Famille: Iridoviridae (5 Genres)
  • Famille: Leviviridae (2 Genres)
  • Famille: Lipothrixviridae (4 Genres)
  • Famille: Luteoviridae (3 Genres)
  • Famille: Metaviridae (3 Genres)
  • Famille: Microviridae (1 Sous-Famille and 1 Genre non inclus dans une Sous-Famille)
  • Famille: Mimiviridae (1 Genre)
  • Famille: Nanoviridae (2 Genres)
  • Famille: Narnaviridae (2 Genres)
  • Famille: Nimaviridae (1 Genre)
  • Famille: Nodaviridae (2 Genres)
  • Famille: Ophioviridae (1 Genre)
  • Famille: Orthomyxoviridae (5 Genres)
  • Famille: Papillomaviridae (16 Genres)
Papillomavirus

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  • Famille: Partitiviridae (4 Genres)
  • Famille: Parvoviridae (2 Sous-Familles)
  • Famille: Phycodnaviridae (6 Genres)
  • Famille: Picobirnaviridae (1 Genre)
  • Famille: Plasmaviridae (1 Genre)
  • Famille: Polydnaviridae (2 Genres)
  • Famille: Polyomaviridae (1 Genre)
  • Famille: Pospiviroidae (5 Genres)
  • Famille: Potyviridae (7 Genres)
  • Famille: Poxviridae (2 Sous-Familles)
  • Famille: Pseudoviridae (3 Genres)
  • Famille: Reoviridae (2 Sous-Familles)
  • Famille: Retroviridae (2 Sous-Familles)
  • Famille: Rudiviridae (1 Genre)
  • Famille: Tectiviridae (1 Genre)
  • Famille: Tetraviridae (2 Genres)
  • Famille: Togaviridae (2 Genres)

Chikungunya

(Address: 1 ieSim, London, United Kingdom, formerly at the Institute for the Environment, Brunel University West London, Uxbridge, UK and 2 School of Population Health, The University of Queensland, Brisbane, Australia)

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  • Famille: Tombusviridae (8 Genres)
  • Famille: Totiviridae (4 Genres)
  • Famille: Unassigned (13 Genres)
  • Famille: Virgaviridae (6 Genres)

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